當螺桿式冷水機長期停機時，首選應該把低壓的製冷劑全部回收到高壓儲存罐液內。當儲液罐裝不下時，應儲存在鋼管內，這個時候，低壓側及螺桿式冷水機組內殘留的製冷劑壓力應保持在0.02Mpa上下，如果低於大氣壓的話，空氣可能會進入機組，同時還應該將所有的閥門關緊。
隨後放盡壓縮機水泵、水套、冷凝器中的冷卻水，防止冬季氣溫低水凍壞設備。斷開壓縮機及其配套設備，如：水泵、冷卻塔、通風機等電源開關，然後對各項運行過程中存在的問題和隱患進行檢查。在長期停機在進行運轉時，按正常運轉順序啟動，運轉外，還要注意下列幾點：
1、再次運轉前，檢查已修理的部位是否漏油
2、當壓縮機運轉后慢慢開啟吸氣閥，防止管路長期停機積存的液體吸入氣缸。
3、用手盤檢修螺桿式冷水機組是否正常，若盤車很費力、可能軸承腐蝕，有必要的話拆開檢查。在啟動電機前應用手盤車，使潤滑油輸送到各個摩擦部分。
