對於運行中的潔凈室，末端高效過濾器的價值並不高，全部加起來可能還不到用戶兩個小時的產值，但更換過濾器的風險和間接費用會很高。
更換過濾器時要停產，停產損失只有業主自己能算出來，這筆損失肯定比過濾器的備件費用高。更換過濾器是十分仔細的操作，潔凈室內的任何東西都經不起折騰，碰壞一個不起眼的設備，其損失可能會高於全部過濾器的費用。更換過濾器后要由專業人員進行檢測，有時還要對空調系統進行調試，然後還要經過一段時間的試運行。檢測、調試、試運行，三項費用加到一起，可能會與過濾器價格不相上下。聰明的業主總是希望儘可能地延長高效過濾器的使用壽命，不是為了省過濾器那幾個錢，他們是想避免因更換過濾器而產生的一堆麻煩。
舉個極端的例子，當代晶元廠潔凈室末端高效過濾器的設計使用壽命為「一輩子」，即：投入運行后永遠不操高效過濾器的心。那種工廠的技術日新月異，一個新項目投產後5~7年就落後了，高效過濾器的「一輩子」也就是7年，為了保險，設計師將過濾器的設計使用壽命定為10~20年。
高效過濾器上積灰過多時阻力增大，大到影響正常送風時，高效過濾器就該報廢。增大高效過濾器的過濾面積或增加過濾器的數量，都能延長過濾器的使用壽命。但那些做法的遊戲空間不大，你不可能無限地增大過濾面積。
要延長高效過濾器的使用壽命，最根本的辦法是將灰塵擋在預過濾器。更換預過濾器一般無須停產，無須調試，所以有經驗的業主會把注意力和金錢花在預過濾器上。
對於10000級和100000級潔凈廠房，預過濾可選用F8過濾器(比色法95%)，這樣，末端高效過濾器的使用壽命一般可達到5年。在國外項目中和國內新建項目中，F8過濾器是非均勻流潔凈室最常見的預過濾器。
對於晶元廠100級、10級或更高級別的潔凈廠房，預過濾器的常見效率級別為H10(MPPS 85%)，許多新建項目索性選用HEPA(對0.3μm粒子的效率≥99.97%)。設計師號稱保證末端高效過濾器使用「一輩子」，其方法不過如此。
在國內過去的潔凈室空調系統設計中，過濾器的常見配置為：粗效→中效→高效。那時末端高效過濾器的使用壽命僅為1~3年，最差的也就幾個月。
有些場合，對高效過濾器使用壽命的規定不是出於對阻力的考慮，而是其他因素。若廠房中有氫氟酸，而車間空調又不是全新風系統，高效過濾器中的玻璃纖維濾紙會受到迴風的腐蝕，為了安全，必須定期更換高效過濾器。有些財大氣粗的製藥廠，每年雨季過後要更換高效過濾器，為的是防止過濾器上任何可能的黴菌污染。有些生物實驗室和危險品打交道的實驗室，在開展一項新的重要課題前，為了可靠，上司會要求使用新的高效過濾器。
要點：預過濾器的效率高低決定末端過濾器的使用壽命。
