變壓器繞線機運行中防火爆炸要注意不能過載運行長期過載運行，會引起線圈發熱，使絕緣逐漸老化，造成短路。經常檢驗絕緣油質油質應定期化驗，不合格油應及時更換，或採取其它措施。防止變壓器繞線機鐵芯絕緣老化損壞，鐵芯長期發熱造成絕緣老化。
防止因檢修不慎破壞絕緣，如果發現擦破損傷，就及時處理。保證導線接觸良好，接觸不良產生局部過熱。防止雷擊，變壓器會因擊穿絕緣而燒毀。短路保護變壓器線圈或負載發生短路，如果保護系統失靈或保護定值過大，就可能燒毀變壓器。
為此要安裝可靠的短路保護。保護良好的接地，通風和冷卻如果變壓器線圈導線是A級絕緣，其絕緣體以紙和棉紗為主。溫度每升高8℃其絕緣壽命要減少一半左右；變壓器繞線機正常溫度90℃以下運行，壽命約20年；若溫度升至105℃，則壽命為7年。
變壓器繞線機運行，要保持良好的通風和冷卻。對於由電流互感器計算變比與實際變比不同而產生的不平衡電流可採用2種方法來克服：
1.採用自耦變流器進行補償。通常在變變壓器繞線機一側電流互感器裝設自耦變流器，將LH輸出端接到變流器的輸入端，當改變自耦變流器的變比時，可以使變流器的輸出電流等於未裝設變流器的LH的二次電流，從而使流入差動繼電器的電流為零或接近為零。
2.利用中間變流器的平衡線圈進行磁補償。通常在中間變流器的鐵心上繞有主線圈即差動線圈，接入差動電流，另外還繞一個平衡線圈和一個二次線圈，接入二次電流較小的一側。適當選擇平衡線圈的匝數，使平衡線圈產生的磁勢能完全抵消差動線圈產生的磁勢，則在二次線圈裡就不會感應電勢，因而差動繼電器中也沒有電流流過。採用具有磁力制動特性的差動繼電器。
變壓器繞線機/的差動繼電器是在速飽和變流器的基礎上，增加一組制動線圈，利用外部故障時的短路電流來實現制動，使繼電器的起動電流隨制動電流的增加而增加，它能可靠地躲開變壓器外部短路時的不平衡電流，並提高變壓器內部故障時的靈敏度。
因此，繼電器的啟動電流隨著制動電流的增大而增大。通過正確的定值整定，可以使繼電器的實際啟動電流不論在任何大小的外部短路電流的作用下均大於相應的不平衡電流，變壓器縱差保護能可靠躲過變壓器外部短路時的不平衡電流。
變壓器繞線機是否能正常的工作正確設定起著關鍵的作用，變壓器繞線機有別於其他繞線機是屬於慢速運轉的設備，由於變壓器的生產工藝決定了設備的頻繁啟動和恆轉矩要求，一般變壓器繞線機需要設定的參數有：圈數設定是設備根據生產工藝需要運行的圈數，它分成總圈數和分別對應每個步序的圈數，設定是應注意總圈數等於各步序圈數的總和；慢車功能設定也是一項常用的參數它主要是控制設備啟動和停車時慢速運行，起到柔和起步和停車緩衝的作用。
正確的設定可以讓操作工人在啟動變壓器繞線機時有個適應拉力的過程，當設備停車時有了緩衝就能停車更為精確；運行速度用於控制設備運行時的轉速，轉速的設定需要結合生產工藝和繞線的實際工況決定，太快和太慢都不利於線圈的成型，快速運行將不利於操作人員的控制，加大設備的振動和噪音，過於低速的運行會很大程度的影響設備的產能和發揮效率，也會影響設備主軸的轉矩輸出；分步序功能是用於控制設備運行的順序，它一般根據生產工藝來決定，一個線圈的成型繞制不單單是漆包線的纏繞，還有很多其它的步驟比如包紙層、包絕緣布等等，所以分步序功能的正確設定將有效發揮設備的效率。
