反滲透系統是整個水站的核心工藝，其主要功能是對經過預處理的水進行脫鹽。本系統包括高壓泵、反滲透裝置、反滲透清洗裝置。反滲透和高壓泵放置在反滲透膜組機架上，是一體化成套設備。成套設備本體上有各種手動閥門並留有各種儀錶介面，便於用戶現場維護和實現水站運行自動化。
經過預處理的水經高壓泵加壓後進入反滲透裝置，由反滲透膜分離H2O和可溶性離子、有機物、細菌病毒及極細小顆粒。97%以上的可溶性離子、有機物、細菌病毒及極細小顆粒隨小部分濃水排入下水溝。
本系統的核心設備---反滲透裝置（簡稱RO裝置），其能否正常運行，很大程度上決定了整個生產裝置能否正常運行。因此必須悉心管理、認真操作。
高壓泵採用多級立式離心泵。過流件材質為不鏽鋼，該泵為反滲透裝置配套泵，具有絕緣等級高，運行效率高的特點。
膜元件選用代表當今國際最高水準的美國DOW公司提供的芳香聚醯胺複合膜，該組件由三層薄膜複合，表面層為芳香聚醯胺材質，並由一層微孔聚碸層支撐，可承受高壓力，對機械張力及化學侵蝕具有較好抵抗性，該組件具有較大的膜面積，超低的工作壓力，對NaCl、CaCl2、MgCl2具有99.5%的脫鹽率。
BW30-400系列低壓複合膜元件具有脫鹽率高、產水量大、操作壓低、抗壓密性好、耐生物分解力強等諸多優點。但對進水有嚴格要求（見表1），必須嚴格按規定的指標執行。
表1
項目
單位
數據
備註
水溫
℃
15～35
PH範圍
3～10
余氯
ppm
≤0.1
OT法
SDI
≤4
15分鐘
化學耗氧量
O2·mg/l
≤3
Mn法
水質穩定指數
負數
硫酸鈣溶度積
濃水側不發生沉澱
鋇、鍶
Mg/l
濃水側不發生沉澱
鐵
Mg/l
≤0.10
錳
Mg/l
≤0.10
鋁
Mg/l
≤0.05
總硅
Mg/l
濃水側不發生沉澱
2、反滲透裝置的安裝
2.1 反滲透裝置的安裝必須按下列條件執行
2.2.1裝置運到現場后，應放置於室內，周圍環境溫度最低不得低於5℃，最高不得高於38℃。當溫度高於35℃時，應加強通風措施。
2.2.2裝置到達后，應在一個月內安裝完畢，並應立即進行通水試車運行。
2.2.3裝置在未進行通水試車前，任何閥門均不得開啟。
2.2.4 裝置就位后，應調整裝置支承點，使組件處於基本水平的位置，且與基礎接觸可靠。
2.2.5 裝置與供水泵相接的管路及閥門在連接之前應進行脫脂處理，供水泵過流部分也應進行脫脂處理。
2.2.6 裝置的產水管最大輸出高度應小於8米。
2.2.7 清洗裝置與R/O裝置間如用硬管連接，則進、回液管均不得直接敷設在地面上，以免損壞。
