看起來，除了數控控制機代替了操縱手柄、手輪外，數控銑床在外觀上與通用銑床確有不少相似之處，但實際上數控銑床在結構上的內含要複雜得多，而與其他數控機床(如數控車床、數控鑽鏜床等)相比，數控銑床在結構上主要有下列幾個特點：
1、控制機床運動的坐標特徵 為了要把工件上各種複雜的形狀輪廓連續加工出來，必須控制刀具沿設定的直線、圓弧或空間的直線、圓弧軌跡運動，這就要求數控銑床的伺服拖動系動能在多坐標方向同時協調動作，並保持預定的相互關係，也就是要求機床應能實現多坐標聯動。數控銑床要控制的坐標數起碼是3坐標中任意兩坐標聯動，要實現連續加工直線變斜角工件，起碼要實現四坐標聯動，而若要加工曲線變斜角工件，則要求實現5坐標聯動。因此，數控銑床所配置的數控系統在檔次上一般都比其他數控機床相應更高一些。
2、數控銑床的主軸特徵 現代數控銑床的主軸開啟與停止，主軸正反轉與主軸變速等都可以按程序介質上編入的程序自動執行。不同的機床其變速功能與範圍也不同。有的採用變頻機組(目前已很少採用)，固定幾種轉速，可任選一種編入程序，但不能在運轉時改變；有的採用變頻器調速，將轉速分為幾檔，程編時可任選一檔，在運轉中可通過控制面板上的旋鈕在本檔範圍內自由調節；有的則不分檔，程編可在整個調速範圍內任選一值，在主軸運轉中可以在全速範圍內進行無級調整，但從安全形度考慮，每次只能調高或調低在允許的範圍內，不能有大起大落的突變。在數控銑床的主軸套筒內一般都設有自動拉、退刀裝置，能在數秒種內完成裝刀與卸刀，使換刀顯得較方便。此外，多坐標數控銑床的主軸可以繞X、Y或Z軸作數控擺動，也有的數控銑床帶有萬能主軸頭，擴大了主軸自身的運動範圍，但主軸結構更加複雜。
