生物安全櫃選購指南最基本取決於生物試驗中所使用的試驗品類型，那麼如何選購實驗室生物安全櫃呢？
1、如果生物試驗中只涉及微生物樣品，可以使用基本類型的生物安全櫃；
2、如果生物試驗中涉及了微生物樣品和微量化學試劑（非腐蝕性），使用裝備外排管道的安全櫃是必要的。因為HEPA過濾器並不能有效過濾清除化學氣體，如果不能外排，將對實驗室內工作人員和環境造成威脅；
3、如果生物試驗中涉及了細胞毒素類藥物，例如各類癌症治療藥物，必須使用的細胞毒素安全櫃。另外，需要明確了解生物安全櫃與通風櫃/超凈工作台的區分。通風櫃和超凈工作台不屬於生物安全櫃，不可使用在涉及微生物材料的實驗或生產過程中。
通風櫃（通風櫥）是為在化學實驗過程中清除腐蝕性化學氣體和有毒煙霧而設計的。由於沒有裝備HEPA過濾器，通風櫃不能有效清除微生物介質。放置在通風櫃內微生物樣品會散播到櫃外，污染實驗室環境。
超凈工作台（超凈台）是為了保護試驗品或產品而設計的，通過吹過工作區域的垂直或水平層流空氣防止試驗品或產品受到工作區域外粉塵或細菌的污染。一旦微生物樣品放置於工作區域，層流空氣將把帶有微生物介質的空氣吹向前台工作人員而產生危險。
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